Кюстендил е една от най-известните балнеологични дестинации в България, където спа хотелите предлагат процедури с минерална вода, релакс и профилактика на здравето. В централната част на града се намира Lime House - апартхотел с оценка 9.7 от гостите, който разполага със сауна, парна баня и гореща минерална вана. Имотите в района обикновено са ориентирани към семейни двойки и гости, търсещи спокойствие, като цените за нощувка варират според сезона и включените спа процедури.
За по-пълноценен балнеолечебен престой изборът може да падне на Strimon Garden Medical SPA Hotel - комплекс с медицински спа център, закрит и открит басейн, фитнес зала и ресторант с регионална кухня. Хотелът е подходящ и за бизнес гости заради наличието на две конферентни зали. Друг вариант е Park Hotel Kyustendil с гледка към планината и градината, безплатен паркинг и семейни стаи. При избор на хотел е добре да се провери дали в цената са включени минералният басейн и сауната, както и дали имотът предлага безплатен WiFi и паркинг.